SecReT4
Protein ID: 189183678
T4SS name [ID]VirB [507]
Gene symbolvirB6
Locus tagOTT_0771
StrainOrientia tsutsugamushi str. Ikeda
Repliconchromosome [GenBank: NC_010793] [Browse all T4SS(s) in this replicon]
Location [Strand]801987..804434 [+]
Producttype IV secretion system protein VirB6
Component typeVirB6
UniProt IDB3CRT0
KEGG IDott:OTT_0771
PDB IDNA
Domain hit(s) vs Pfam TrbL [PF04610], Evalue: 1.3e-15, Aligned region: 543..624
Protein Sequence: 815 a.a.     [Download]
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TTAAAGCTATATCTGGAATTGATATGATTAATATGGGTGATATTATACCTGATGAGGTTAAAGATGCAGC
TGATGACATTAAAGATGGGGTTAAGAAAGTTGTAGATACATTATCAAATATAACTTGCGAAACTAGAGGA
GTTAACAATTTATTGTTTAAAGATGAATTTTCTCATACTTGTACTCCTGCTCCATTTTTTAGTTTAGCAA
CATCATCTATCTTAGGAATAGGCACCTATCTTCCAATGGTGTTAAAGTTAAATATGACTAATGCAGAATT
ATTTGGCGAACAATTTCCTGGAGGACAATGTCTTAAAAAAAATCGAGCTGATCCTGCTGATCCGCGAATT
AGCTTTGCTTTATGTAATAATGTTAAGTTAATGGTAGCTGCAGCAACTGCTATAGGTGGGACTGTAGTCA
ATGCTGCTGTTGCTATTGCTTCTGGTGATAACGTTTGGGATGCTGTTGCAAGAGCATGGCATATTAAGGC
TCAAGATATCTTTGAAGTATATAAGGATAAAGAAGTAGGACATTATGATCACTTTGTGGATATTAATCTT
GCTGGGTCTCCTTACATACCATATAAGGTAGTACGAGATAAAGATAAAATTTGTGTTGCTGCAGGGACTT
TATTGGGTGGATATTTAAATGTAGGGTGTAAGTATATTAGTGAGCCTTGTAGTAGATCTATATATAGTAA
TTTTTTAAATAACTCTTCTAGTGTATCAGAGATATCAAAGCCAGTATGCCATACCGGAAATGGTAATAAA
GAATCAAAAGAATTGTATGATAAAAACAGATTAGTTGAATGTGGAAATATGCGTGGGTGTTATGCAGATG
CAGTAGAAAATTCTAAAACTCTGCTACCTATTACTGGTCCTATAATTAAGTGTTTTGTACAGATGGCTCG
TAAAGTTCTTGGAGAATCAACTGTATGCAAGCTAAATGCTAAAGGTGATGAGGTTATAACAAATGCTAGT
GATGTTAATATGATTAGTAAATTTAGCCGTCACATGCGCAGGGCAGTTACTGCTTTTATGTGTTTATATA
TCATTTTTTGGGGATACAATATTTTGTTATCGCCAAATGAAATAAGTCGTAAAGATGTTATTAATGCTGT
TTTAAAGATAGTGTTAGTAACATATTTTTCGATTGGAATTAGTACTGGTGATGATAAAAAATTAATTAAT
GGAGTACAAAGTTGGGGTATGGAGTTGCTACGCGGAGATGTAATGGCAGAAGTAGCAGCTTGGGTAATGA
CAAAATCTAGTAATGAAGAAGGTAAAAAAGTATCTGGTTTATGCAATTTTCAGCCTAGTGATTATGATTC
TAGTAAACACGGAGCTGATGCTAGGCAGCTTTTAGCATTATGGGATTCTATTGATTGTAGGCTAACACAT
TATTTAGGAATAAATGCTATTAAAGATTATGTTAGGCAAAAAATTCAAGCTGTAAAGGGTAGTGGTGGAG
ATCCTTTAGGTAACTCCATACCTCCATATTATTATTTGTTAGTTCCTGCTTTATGGAGCGGCAATATGAC
TTTATTGGGGCTAGTTTTGTTTTATCCATTGCTTGTAATATCAATAGCAGCATACATGGTTAATGCATAT
ATAGTATGTATTATTGGAATATTAATCTTAGGGTTATTGGCTCCTATATTTGTACCTATGGTGCTTTTTG
AATATACTAAAAGTTATTTTCATAGTTGGTTAAAATTAGTAATATCATTTGTACTACAGCCTATGGTTGT
TATTGTTTTTATGATGATGATGTTTCACGTTTATGAATATGGCTTTTATACTGATTGTGCATATGATTAT
AGACTTGTAAAAGATAGTAGTGGCAATGGTTCAAGAATGAGAAAAATGTTTTTTATTAATGTTAATGATA
AAAATTTATATGATGGTGATGCTGACCAAAAAATTGCTAGATGCAAAAAAAGTTTAGGATGGATGTTAAA
TAATCCTCTGTTTGCAGTGATTAATACTGCTAAAACTGTAGCTAAGGATGTTATCTCAGTAGACAACGTA
GGATCAGAAGATGATTCAGAAAATCATCAGTTTAGTAATGCAGTAGAAGTAGCTCAGGGATTATTTTTTA
AAACTACTCGCTCTATTTTTCAATTAGTTAAAGATTTAATAATGGCGTTACTAGTTGCTTGTTTAACTTT
ATATTTGATTTATCACCTTAGTGATTCACTGTCACAGTTTGTATCATCGTTAGTAAGCGGAATAAATCTT
TCTGGTATGACTGTTAATCCTAAGCAAATGCATGATACTTTAGGCTTTTTAGCAAAAAAGGGAGGAGGAA
AAGCGAGTTCAGCTATGAAAGGTGGAGGAGGTAGTTGGCAATCTATGAGAAGTGGCTCTCTTAAATAA

Protein ID: 189183679
T4SS name [ID]VirB [507]
Gene symbolvirB6
Locus tagOTT_0772
StrainOrientia tsutsugamushi str. Ikeda
Repliconchromosome [GenBank: NC_010793] [Browse all T4SS(s) in this replicon]
Location [Strand]804456..808343 [+]
Producttype IV secretion system protein VirB6
Component typeVirB6
UniProt IDB3CRT1
KEGG IDott:OTT_0772
PDB IDNA
Domain hit(s) vs Pfam TrbL [PF04610], Evalue: 1.7e-18, Aligned region: 880..972
Protein Sequence: 1295 a.a.     [Download]
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ECIKKEELRYQNPDILQEKIQLLESSAKQAWNNAQNHQFSSNIEKLNAVTNAGAKTREIISLSEQLKKAL
VNEGNARWAAFKIEKGKTNGGKLSKDKDFQQHKSLLNEQKAALKLAQKFGNNASGQYKVIKASARDLVLV
AGLDFWNALLLYKKIDDELDSKVRNGADKKSILIAKKKVLYEIEKVLKAFVEGRDMYNKFVEWVIGYSDI
TEAKEKGAIEFLLQNLSYSTVMRSASFETTLKAVIEIYKNGDFINELKLQNESVKTDIAEIERSIQVAED
EMKRKQEEEEAKKLLEFQNKVKKAKEEVDAAKDKFKEKQTQAQEAYDQANASGDLEDKIEALNKKKKEYE
AAKKYKEALDKAIDIGNNNPDLVRERDSLGNDIDNLSQSIDQMTDDVNRDKEIYKQQFEEDKNSSVSANC
DFSQYRSISPESSVFTLASFVYQNINFKCGNVCNTADKGFNLCLKVKKSDLCRDCIPIYIGPQSEFKSIR
KLFDTSGVKKGRRDPILVTENAVKNIGFKVEHTDKISCLKIKTSYGDIPIVCKNISADIDLIPQARSNNR
ICSLSTTKSRVPFNFSGRAIGCLKEALDKMFYADSITHDQVSSASILKPLSSFQRGMTLTVKAALMLYII
FFGIKMIFVKRFFSLERLVTGVLQILIVMYFSVGLGPMTNKDGKISYNNGMQDHFLPFLSSVTSELAHMV
FSSVGSDSAVGGTKLCYFDPNKDYTPDARYYALWDAIDCRIGYYLGFRLLHNYTVDRSKPSLGGKLVGSS
IGTSANDDITKHLSNIKDGHALKKDDTFLVFPTLWGLLLSGEIIFFLVMLLFVIIFLTLFWRFMAVFITS
LVNLYVMCYISPIFIPMVLFEKTKSMFNNWLHLTLSFALQPAIVAAFIALFVTLMDSITYKTCQFARYDY
QQGNKILSTFELRVPDRYIQDHGLFDDAYNSDAAKICRESAGYRLVEYFNGKNWHQRIFLFFKAFVVYPE
PDFLPTMIVVLLFCGIFYYFFQEAHRFAAVITSGITAVNMELPSLRIPSFRNKSTRTKGGKDDKEEEASD
KFSSRGGIDKTATDKISSRSNIESSAQDKISTGLKSNGISGVKHGLKKDHDAIRAAKKFDISNNDEVIGA
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IETRKSNIESDALSKKIDAKDLNEINKGSDDKKNI
 
Nucleotide Sequence: 3888 bp     [Download]
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ATGATAAAGCATTTACTATATAACTTTAGGGTAGTAATTAACAATCATTCTGTTCTTAAAGCTCTTAAAG
AGGCAATTTGTAGTGTATTGTTGCTAGTTATTGTACTGCCATCCATTGCTTACGCTGGAAAAGATTGCTG
TAGTAAGCAGAAGAATAAGCTTAGATGTTGTACCTATGATCAACAATTTTGTTATCCATTAGTAAGGTCC
GAATGTATCAAAAAAGAAGAATTACGTTATCAGAATCCTGATATATTACAAGAAAAGATACAGTTACTTG
AATCTTCAGCTAAGCAAGCATGGAATAATGCTCAAAATCATCAATTTTCATCGAATATAGAAAAACTTAA
TGCTGTAACTAATGCTGGTGCTAAAACTAGAGAGATCATTAGTTTATCTGAACAATTGAAAAAAGCTTTA
GTAAATGAAGGTAATGCTAGGTGGGCTGCGTTTAAGATAGAAAAAGGTAAAACTAATGGTGGTAAATTAA
GTAAAGATAAAGATTTTCAGCAACACAAATCATTACTAAATGAGCAAAAAGCTGCATTAAAATTAGCTCA
AAAATTTGGTAACAATGCTTCAGGGCAATATAAGGTAATTAAAGCTAGCGCTAGAGATTTAGTATTAGTT
GCTGGATTGGACTTTTGGAATGCGTTGTTACTATACAAAAAAATTGATGATGAGTTAGACTCGAAAGTGA
GAAATGGTGCTGATAAGAAAAGTATATTAATTGCAAAAAAGAAAGTGCTTTATGAAATAGAAAAAGTTTT
GAAAGCTTTTGTAGAAGGAAGAGATATGTACAATAAATTTGTAGAATGGGTTATAGGTTATTCTGATATA
ACAGAAGCAAAAGAAAAAGGCGCTATTGAGTTTTTATTACAAAATCTGAGCTATAGTACAGTAATGAGAT
CAGCCTCATTTGAGACCACTTTGAAAGCAGTAATAGAGATATATAAAAATGGTGATTTTATCAATGAATT
AAAACTTCAAAATGAAAGTGTAAAAACTGATATTGCTGAAATAGAGCGTAGCATACAAGTTGCTGAAGAT
GAGATGAAGAGAAAACAGGAAGAGGAAGAAGCTAAAAAATTATTAGAGTTTCAAAATAAAGTTAAAAAAG
CTAAAGAAGAAGTTGATGCTGCTAAAGATAAATTTAAAGAAAAACAGACTCAAGCTCAGGAAGCTTATGA
TCAAGCTAATGCTAGTGGAGATTTAGAAGATAAAATTGAAGCTCTAAATAAAAAGAAAAAAGAGTATGAA
GCTGCTAAAAAATATAAGGAGGCTTTGGACAAAGCAATTGATATTGGTAACAACAATCCTGATTTAGTTA
GAGAGCGTGATAGTTTAGGAAATGATATAGATAATTTATCTCAAAGTATTGATCAGATGACAGATGATGT
TAATAGAGATAAAGAGATATATAAGCAACAATTTGAAGAAGATAAAAATTCATCAGTTAGTGCAAACTGT
GATTTTAGCCAGTATAGAAGCATCTCTCCTGAAAGCAGCGTTTTTACTTTAGCTTCTTTTGTATATCAAA
ATATTAATTTTAAGTGTGGAAATGTATGTAATACTGCAGATAAGGGATTTAATCTTTGTTTAAAGGTTAA
AAAGTCAGATCTGTGTAGAGATTGTATTCCAATATATATTGGTCCGCAATCTGAATTTAAGTCTATTAGG
AAGTTATTTGATACTAGTGGAGTAAAGAAAGGTAGAAGAGATCCTATACTAGTAACTGAAAATGCAGTAA
AAAATATTGGATTTAAGGTTGAACATACTGATAAAATTTCTTGTTTAAAAATCAAAACATCTTATGGAGA
TATTCCTATAGTCTGTAAAAATATTAGTGCTGATATTGATTTAATACCTCAAGCTAGGAGTAATAATAGA
ATTTGTAGTTTAAGTACTACAAAAAGTAGAGTGCCTTTTAATTTTTCTGGTAGAGCTATAGGTTGTTTAA
AAGAAGCATTGGATAAGATGTTTTATGCTGATTCAATTACTCATGATCAGGTATCTTCTGCTAGTATATT
GAAGCCTCTTTCAAGCTTTCAGCGTGGTATGACATTAACTGTTAAAGCTGCTTTAATGTTATACATAATA
TTTTTTGGCATCAAAATGATATTTGTTAAGCGTTTTTTTAGCCTAGAGAGATTAGTTACTGGAGTATTAC
AGATACTAATTGTAATGTATTTTTCTGTTGGGCTAGGTCCAATGACTAATAAAGATGGGAAAATAAGTTA
TAATAACGGTATGCAAGATCATTTTTTGCCATTTTTAAGTTCAGTTACCTCAGAATTAGCTCATATGGTA
TTTTCATCTGTTGGTAGTGATTCTGCTGTTGGCGGTACTAAATTATGTTATTTTGATCCTAACAAAGATT
ATACACCTGATGCTCGTTATTATGCATTATGGGATGCAATAGATTGTAGAATAGGATATTACTTAGGTTT
TAGATTATTACATAATTATACTGTAGATAGGTCAAAGCCATCACTTGGTGGTAAGTTAGTTGGATCATCT
ATTGGAACTAGCGCTAATGATGATATTACCAAGCATTTGAGTAATATTAAGGATGGTCATGCACTTAAGA
AAGATGATACTTTCTTAGTATTTCCTACTTTGTGGGGACTGTTATTAAGTGGTGAAATTATCTTTTTCTT
GGTAATGCTACTGTTTGTTATAATCTTTTTAACGTTATTTTGGAGGTTTATGGCTGTATTTATTACTAGT
TTAGTAAATTTATATGTCATGTGCTATATATCTCCTATTTTTATTCCTATGGTATTGTTTGAAAAGACAA
AATCAATGTTTAATAATTGGTTACATTTGACATTATCTTTTGCATTACAGCCTGCAATTGTTGCAGCATT
CATTGCGTTATTTGTGACTTTAATGGATTCAATAACGTATAAAACATGTCAATTTGCAAGGTATGATTAT
CAGCAAGGGAATAAAATTTTGAGTACTTTTGAGCTTCGTGTACCTGATCGTTATATTCAAGACCATGGCC
TCTTTGATGATGCGTATAATAGTGATGCTGCTAAAATATGTAGAGAGAGTGCTGGATATAGGTTAGTAGA
ATATTTTAATGGAAAAAATTGGCATCAAAGAATATTTCTTTTCTTTAAAGCATTTGTAGTATATCCTGAA
CCAGATTTTTTACCTACTATGATTGTTGTATTACTATTTTGTGGAATTTTTTATTACTTCTTTCAGGAAG
CACATAGGTTTGCGGCAGTTATTACTAGTGGTATTACTGCTGTAAATATGGAGTTACCAAGCTTAAGAAT
TCCTAGCTTTAGGAATAAGAGCACTAGAACCAAAGGTGGTAAAGATGATAAAGAAGAAGAGGCAAGTGAT
AAGTTTAGCTCTAGAGGTGGTATAGATAAAACTGCTACAGATAAAATTAGCAGTCGGTCTAACATCGAAT
CATCAGCTCAGGATAAAATTAGTACTGGATTAAAAAGTAATGGTATTAGTGGCGTTAAACATGGCTTAAA
AAAAGATCATGATGCTATTAGAGCTGCTAAGAAGTTTGACATTAGTAATAATGATGAAGTTATTGGTGCT
GATAAGTTTAGTACTAGTGGAAATAAGCAGGCTGATAAGTTAAGTTCTGAAAATATTAAGCCAAGAGATA
CTAGTGTAGTTTCTGCAGAAGATAAATTTAGTACTTCTTTTAAACTTAAAGATCATAAAGATATTGTTCA
ATCTGAGATTGATAAGAAACTAGAATCTAATGTTAGCGATAAGAGTAATAGTACTAGCAGTAATCAAACC
ATCGAAACAAGAAAGAGTAATATTGAATCTGATGCCTTATCAAAAAAGATCGATGCTAAGGATTTAAATG
AGATTAATAAAGGTAGTGATGATAAGAAAAACATCTAA

Protein ID: 189183680
T4SS name [ID]VirB [507]
Gene symbolvirB6
Locus tagOTT_0773
StrainOrientia tsutsugamushi str. Ikeda
Repliconchromosome [GenBank: NC_010793] [Browse all T4SS(s) in this replicon]
Location [Strand]808397..811669 [+]
Producttype IV secretion system protein VirB6
Component typeVirB6
UniProt IDB3CRX4
KEGG IDott:OTT_0773
PDB IDNA
Domain hit(s) vs Pfam TrbL [PF04610], Evalue: 2.3e-22, Aligned region: 665..861
Protein Sequence: 1090 a.a.     [Download]
>gi|189183680|ref|YP_001937465.1| type IV secretion system protein VirB6 [Orientia tsutsugamushi str. Ikeda]
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GVENTEIGYAYSRPEFDWFNDTSLDWQKGTNDTFGIIKRTKQVRADCQEGKKNYSPLCGRYSPWGEGDNY
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KACPEKYLLDCKRGVLADGLPEEYRDDGTRTVPATLTEQDRNDIKSLGRIACSNRLDEQLVKNRQKVYSW
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YMIRPDINIESMKNSVGGYVLYLKQNSCVRKSGVAFDDSKFHGRGKILYAIVPAGVDVNKLKSHELDVYT
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Nucleotide Sequence: 3273 bp     [Download]
>gi|189182907|ref|NC_010793.1|:808397-811669 Orientia tsutsugamushi str. Ikeda, complete genome
ATGCAATCTAAAATTATCAAATTTGCAATTATAGCAGTTTGTATAGCTGTAGTAAGTTTTATCTTAATGC
TTTTTGGCGCATTAAGATCAGGCGATGATTGTTGGTACCGTTATAATACAGATGGGCAAGATTTAGATGT
TATTCGATTAACTCAGAATGTTAGAGCTTCTGGGCAGTATGATAGTTTTCGACTTGGAGGAATAGTTGAT
CCTGGTAAGCCATGTGGTCTTTGGGTAAAATCAGATTTTTATGTTTCAGTACCTGAAGAAAATGGGCAAT
TAAAACCTGTAAATATTGATTTTCTTATTGATGGAACAGTGAGCCTTTGTCAGGCATACTTACCAAAAAA
TGCTTTAACTTGTAAGCTGAAATATAATGATGGTAACGAATGTAATATTAGTGATATTAATAAATTTTTT
AATGGAGAGAAGAGTGATTGTATAGAAGATTGTGAAGATAATACTGATGATAGTGGTAATCTTATTCCTA
TTCCTAGAATTTTAGATCCAGGCGATGGTTTACCAGTAATATTAAAGGCGAATGTTGGAGAGTGGCGTAA
TCTTGCTCAGGTATCTGCTGGTGATGAAATAGAAGTCAAAATTGGTAGAAATCAAAATTTTAGTCACGGA
GGGGTTGAGAATACCGAAATAGGCTATGCTTATAGTAGACCAGAATTTGATTGGTTTAACGATACAAGTC
TAGATTGGCAAAAGGGTACTAATGATACTTTTGGTATAATTAAAAGGACTAAGCAGGTTAGAGCTGATTG
TCAAGAAGGAAAAAAGAATTATAGTCCACTATGTGGAAGGTATTCCCCATGGGGAGAGGGTGATAATTAT
ATCAAACAGTGTGATGAATGTAAAGGATGTACTTGTGAAGATTGTGGTATGAAACCAAAATGTTCAGGAT
CAAAGCCGGTATGCCCAGCACCTGAATGTGAAATGGCTGGTGCGCATGGATGGGCTTCTAAAGCGTTTTG
GGTATTTAACACTGATCTTGGTAAAGACAAATGTTTTTATAAAGGTACTGTTAGAGATTTTTGGGGAGGA
AAGGCTTGTCCAGAGAAATATTTGCTAGACTGCAAGCGCGGTGTTTTAGCTGATGGATTGCCTGAAGAAT
ATCGTGATGATGGTACTAGGACAGTACCTGCAACTTTAACTGAGCAAGATAGAAATGATATTAAGAGTTT
AGGTAGAATAGCTTGCTCTAATCGACTAGATGAACAATTAGTAAAAAATAGACAAAAAGTTTATTCTTGG
AGATCTGCTACTTATGCTACTGATTTAAAGTATCGCTTTAGTAGTGCACAGAACAAAGATTCTGTATTAG
GCAATAAATGTAAAAGTGATTTTCCTTCAGGTAAGGATTTAGCTACTGGTTGTTATGGAATAACTAAAGT
AAATCAGGATTTAATAATATATAAAGATCAGATTTCAGAAACGTTATTTAGTGGACCAAGATACTTACAA
TATATGATTCGACCTGATATTAATATTGAAAGTATGAAAAATAGTGTTGGAGGATATGTATTATATTTAA
AACAAAATTCATGTGTTAGAAAGTCTGGAGTCGCTTTTGATGATAGTAAATTTCATGGTCGAGGAAAAAT
ATTATACGCGATAGTACCTGCTGGAGTAGATGTAAATAAACTAAAATCACATGAGCTTGATGTATATACT
ACAGGATCACTTGATGTAAAGGTTGAGGATTTAGTAGGTAAAGCTAAAATCAGTTCTTCTCAGTCAGGGT
ACATTTGGTTTAAAATTCTAAATGATGAAAAAGATTATAGAGCTAGTGTTGGTGAATATAAAATTACTAT
GAGTACCATAGTACCTAGAGGAAAGTTTATAAGTAAAGTGTTAAATCCAATAATAAGGATATTTGAGAAT
AAAATTGCTAATGCTTCAAAGACAATGTTTAAAAATATGACTTGTTATCAACAGAATGATAAGTCTAGAT
GTACAAATTTCTTTAATTACATTAGAGCAATGTTAACTCTTTATATTATGGGTTGTGGATTTGCATTTAT
GCTAGGAGCAGTTAATTTTACTGCTAAAGAATTAGTTATTAGAATTGTTAAGGTAATAATTGTTAGTGGC
CTGATAAATGAAGGGACTTTTAATTTTTTTAATGCTTATCTATATGATTTAATTATGAATTTTAGCAAAC
AGTTAATGGTTAATGTATCAGGGTATGAGTATGATCAAAATATAGGAGTGTTTCTATTTTTAGATGAATT
GATGAGTAAAATATTTTTTAATAAAACATTTTATGTTCAGTTATTATCTCTTTTAAGCATGGGGCTAATG
GGAGTAGTTTATTATATTATAATATTTGTTCCTATAATTTTGATAATTATATCTTTGTTAAAGACTATTA
TGGTATATTTGGTATCAACTACTGCTGTTGCTTTATTGGTAGGACTTGCACCATTGTTTCTTTCTTTTAT
GCTTTTTAATAGAACTTGGTATTTATTTGATAATTGGGTTAGAATGCTATTTCGGTATTTAATAGAGCCA
GTTATATTAATGGCAGGAATAACAATTTTAACTCAGCTTTTTATTGTTTACTTAGATTTTGTGCTAGGAT
ATAGCGTTTGCTGGAAATGTGCTATAGTATTTAAGCTTCCAAAAATAGATGCATTGGGAGGTATACTAGG
TAGCTATGGTGGGCAAGAGTTATTTTGTATAAATTGGTTTGGTCCATGGGGGTATGATAATAGAGCTGAT
AATAACATAGGATTAGCAATGAATTATATTATTGCTTTAGTAATTATTGCTTACTGTATGTATAGTTACA
TTGACTTTTCAAGTTTAATGGTTGATATTCTTACAGCTGGAGGTGCTGGAGGGATTGCGCCTTCTGCAGG
TCATATTGCACCTCAAGTTTGGGATACTGCAGTACAGTGGACTGAAAAGGCTGTTATGAAGGTGGCATCG
ATAGGTAAAAAAGGTAGCTTTGCTGTACGGAAAGGAATAGGTAAGGGGATATCTCATGCGAAAAGTAAGT
ATTCAAGTTCACAAACTGAAAAGTCTAAAGATAAAGATAATGTGGTTAATAGAAGAACCAATCTTGAAAA
TAAAAGCCTAAATGACAAAGGAGGCTCTGCTATTAAAAGAAATAGCAATGTTGAGAATGTAAAGCCTAAC
CAGAATACTTCCCTCAGGGTGAATAATCAAGAAATTGATTTGAATAGCCAAAAACCATCGCATAATGAAT
CTTCTGTTAGAAGGCATGATTTGAATAAGAAAAATTTTGAGAATAATGACTAA

Protein ID: 189183681
T4SS name [ID]VirB [507]
Gene symbolvirB6
Locus tagOTT_0774
StrainOrientia tsutsugamushi str. Ikeda
Repliconchromosome [GenBank: NC_010793] [Browse all T4SS(s) in this replicon]
Location [Strand]811662..814226 [+]
Producttype IV secretion system protein VirB6
Component typeVirB6
UniProt IDB3CRX5
KEGG IDott:OTT_0774
PDB IDNA
Domain hit(s) vs Pfam TrbL [PF04610], Evalue: 1.6e-19, Aligned region: 554..749
Protein Sequence: 854 a.a.     [Download]
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SPTWLSVADVKWIDIQANSNNNWIDSGIMTKAGKSISVEIPKISQNFRKLQKRYLVLHRVDPRFPVIGQT
FIIELGTNNKPISRLHNFENGKLLNYQNENSSNFQNGSTNFTNAINLQKKFFNGADTKISVKAGDVIDIA
LISSVDFFNKLQLKGGTEKSGFTGELYPRWDDYKYYKPYGIYTVSLKSNVGVVDNALLVTGQTSDKKALS
KLLVGVKSIDSISSFEKCNLNNLSKSKSCIMESGIGMEIKLDQEVLKSKFDKFLVGYNVGNAHSSAFLDK
PIEGMYHIVAKSDGDLSFSTPLFNNNVKYRTNGLQDVEYSSILSSCSTLNEFEQKYLNSILSSKQEIIQG
IVVDKTLVGRYLMYITIDRHNIVSDEYDGDIEYIISNTTPTLSTKGTTLPRNGINIVTPESAKLWFRFVK
KNNEQFNLKVTVPPDSEGKIKVAGFFYDNIYIPIKLKVEKFSKLFYFGLAKNAALKKVFSILAILYITLY
GIYFLLGVVKVTAYDLLIRCSKIIVIAALFNESSQHIFYDTLFPMFDGGINSLISYAVKTTASDVDNPFK
FFDLVVSRYIDVNFLKIILIEIVNIHNGLTILGILTLWSIMKFVTIMVKVCMELLMSMIAIAILVGLAPM
FIVFILFDRTAEIFKRWLSALLLNTLMPVIMIIFILIINELMLVAVEAAFPEIRICWGTLFDIELNLDLS
AIGLPTAFSIPLMAVPFYNVVFIGGNLFNAMDLGNSFAGSLAGVFLLYNLVLLAGTLVGSQVFTKGINRK
GMSYVKSIMMQLLS
 
Nucleotide Sequence: 2565 bp     [Download]
>gi|189182907|ref|NC_010793.1|:811662-814226 Orientia tsutsugamushi str. Ikeda, complete genome
ATGACTAAAATACTTAAAATTCTAATAACAAAAAACAAATCATTGATGACTTACATAAATATATTGATTT
TGCTATCATATATGTTTGTGTGTACCAGTATTCAAGCTTCAAATGAGTTACCTCAAGCTGGAGCGCAACT
ACCTACCTCTAATTCTCTTCAATGGATGGATAAATATCCTAATGATAGTAATACAGGGTGTACAAGTGTA
TCACCTACATGGTTGAGTGTTGCAGATGTAAAATGGATAGATATACAAGCTAACTCCAATAATAATTGGA
TTGATTCTGGTATTATGACTAAAGCTGGCAAAAGTATTTCAGTTGAGATTCCAAAGATTAGTCAAAATTT
TAGAAAGTTACAGAAAAGATATCTAGTATTACATAGAGTTGATCCGCGATTTCCTGTAATTGGGCAAACT
TTTATTATTGAATTAGGCACAAACAATAAGCCTATTTCACGTCTTCATAATTTTGAGAATGGTAAACTAT
TGAATTACCAAAATGAGAATAGTAGTAATTTTCAAAATGGTAGTACTAATTTTACAAATGCTATAAATCT
GCAGAAAAAATTTTTTAATGGCGCAGACACTAAAATTAGTGTTAAAGCTGGTGATGTTATCGATATAGCT
TTAATTTCGTCTGTCGATTTTTTTAATAAATTGCAGTTAAAAGGTGGTACTGAAAAATCTGGATTTACTG
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GTCTAATGTTGGTGTTGTTGATAATGCTTTATTGGTTACTGGTCAAACTTCTGATAAGAAGGCATTAAGT
AAGTTATTAGTTGGTGTTAAGAGTATTGATAGTATAAGCAGTTTTGAAAAATGTAATTTGAATAACTTGT
CTAAGTCTAAATCCTGTATAATGGAATCTGGAATAGGAATGGAAATTAAATTGGATCAAGAAGTTCTAAA
GTCTAAGTTTGATAAATTTTTAGTTGGTTATAATGTGGGTAATGCGCATAGCAGCGCTTTTCTCGATAAG
CCAATAGAGGGAATGTATCATATAGTAGCAAAAAGTGATGGTGACTTGAGTTTTTCTACGCCATTGTTTA
ATAATAATGTAAAATACCGTACTAATGGACTACAAGATGTGGAATATAGCAGTATATTAAGTAGCTGTAG
TACATTGAATGAATTTGAACAAAAATATTTAAATTCTATTCTTAGTTCCAAGCAAGAAATAATTCAAGGA
ATAGTTGTTGATAAAACATTAGTAGGGCGGTACTTGATGTACATAACTATTGATAGACATAATATAGTTA
GTGATGAATATGATGGTGATATAGAGTATATTATTTCAAATACAACTCCAACCTTATCTACTAAAGGTAC
TACTTTACCTAGAAATGGAATAAATATAGTTACTCCTGAATCAGCAAAGCTATGGTTTCGTTTTGTAAAA
AAAAATAATGAACAATTTAATTTGAAGGTAACAGTTCCACCTGATAGTGAAGGGAAAATAAAGGTTGCTG
GATTTTTTTATGATAATATTTATATACCAATCAAGCTAAAAGTTGAAAAGTTTTCTAAATTGTTTTATTT
TGGCTTAGCTAAGAATGCAGCTTTAAAAAAGGTATTCAGTATTTTAGCAATTCTTTACATTACACTATAT
GGTATTTATTTTTTATTAGGAGTAGTAAAAGTTACTGCTTACGACTTACTTATACGATGTAGTAAAATTA
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TGGTGGTATAAATAGTTTAATTAGCTATGCTGTTAAAACTACTGCCAGTGATGTTGACAATCCGTTTAAG
TTTTTTGATTTAGTTGTTAGTAGATATATTGATGTTAACTTTCTAAAGATAATATTAATTGAAATAGTTA
ACATACATAATGGTTTGACGATATTAGGAATATTAACTTTATGGTCAATCATGAAATTTGTAACCATTAT
GGTTAAAGTGTGTATGGAACTTCTGATGTCTATGATTGCCATTGCAATATTAGTTGGGTTAGCACCGATG
TTTATAGTTTTTATATTATTTGATAGGACAGCAGAAATCTTTAAAAGATGGCTTAGTGCTCTTTTATTAA
ATACATTAATGCCAGTGATAATGATTATCTTTATATTAATTATTAATGAATTGATGTTAGTTGCAGTGGA
AGCTGCTTTTCCTGAAATTAGAATTTGTTGGGGCACATTGTTTGATATAGAATTAAATCTTGACTTATCT
GCAATTGGATTACCAACAGCATTTAGTATTCCACTGATGGCTGTACCTTTCTATAACGTTGTTTTCATTG
GTGGAAATTTATTTAATGCTATGGATTTAGGTAACAGTTTTGCAGGTTCGTTAGCAGGAGTTTTTTTACT
GTATAACTTAGTTTTACTAGCTGGAACACTAGTTGGGTCTCAAGTATTTACTAAGGGAATAAATAGAAAG
GGAATGAGCTATGTAAAAAGTATCATGATGCAACTTTTAAGTTAG

Protein ID: 189184311
T4SS name [ID]VirB [507]
Gene symbolvirB6
Locus tagOTT_1404
StrainOrientia tsutsugamushi str. Ikeda
Repliconchromosome [GenBank: NC_010793] [Browse all T4SS(s) in this replicon]
Location [Strand]1437129..1439345 [+]
Producttype IV secretion system protein VirB6
Component typeVirB6
UniProt IDB3CU15
KEGG IDott:OTT_1404
PDB IDNA
Domain hit(s) vs Pfam TrbL [PF04610], Evalue: 3.8e-20, Aligned region: 325..510
Protein Sequence: 738 a.a.     [Download]
>gi|189184311|ref|YP_001938096.1| type IV secretion system protein VirB6 [Orientia tsutsugamushi str. Ikeda]
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ELDSGFLDTTPDGNIVKTGGYFHKYQDQEDEQYVGGRLYFKILDRFYDDNNGQYKIIIKSGVGDEKDSPE
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RTVKILVISVLLNSDTAWKFFYNYLFFIFVDGPQFIIKTINQATAIGPGSSSILGLMIAPHTLKKLFSIL
FVDWGGFIYIICYLILLYYIFIISFKATVLYLNALILVGIGIIVGPVFLCFVLFQFTKPIFENWIKQLTI
YALQPVILFAGIAFVGMFIRHEIYASLGFRVCEVPFPPIANTLIKIISGDSSKKQSLLNLWFPAQVLKKT
LLFSQKCANIPVPEDHIVYLDQNAWKCSDGISGNSKQLITSTNSSKEKHCSAYECKANRYVELPFLDPNI
NKDRSRIRNFFAGNFVQWDSLLLLAACVFLLSMFNDNAIALANYISSGGDRSSASEKSTTAIVSTVTPPS
PTTFIPAAFSKIGQQRTKNSNSHSNSNSRSGINTGPKK
 
Nucleotide Sequence: 2217 bp     [Download]
>gi|189182907|ref|NC_010793.1|:1437129-1439345 Orientia tsutsugamushi str. Ikeda, complete genome
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TCTTAAAGTTTATTGTTAGTATTATACTATTCTGCTCTGTAATTAGTTATAGTATAGCTGAATGTATAGA
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TTAAACATTGGAATTATCATGAATACGATAATGATATCAGTCATCTTTCAGCTTGGTCAGCATGGTATGG
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AAAACTTTTTCTGATTCATATGATGATAATGATGATGTACCAGTTATTAATCCTCCATGTTTATTCAAAC
ATGGTATTGGCCTTTATGCTTTGATTGCAAAGCCTGGTGTTGATCCAAACGCTAATGTTCATTCTCAATC
TTATGGCATTTCAAAAAAAACTATTAATTTTCATGTAGGCCAAAACTACCTTAGCTCTCTTAATTCTACT
GAGTTAGACTCAGGTTTTTTGGATACTACACCTGATGGAAATATAGTCAAAACTGGAGGATATTTTCACA
AATATCAAGACCAGGAGGATGAACAGTATGTTGGAGGAAGATTGTATTTCAAAATCCTAGATAGATTTTA
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ATTCGTTGCATTTAGTGGGCTAGCTTTCTTAATAGGTAATATTAATATGACTGCTCATGAGTTAGTACTT
AGAACAGTAAAAATTTTGGTAATATCTGTTTTGCTGAATTCTGATACAGCTTGGAAATTTTTCTATAATT
ATCTATTCTTTATTTTTGTAGATGGCCCTCAATTTATTATTAAGACTATCAACCAAGCAACAGCAATAGG
ACCAGGATCATCAAGCATATTAGGGCTGATGATTGCTCCTCATACTTTAAAAAAGTTATTTTCAATACTA
TTTGTAGATTGGGGCGGGTTTATTTACATTATTTGTTACTTAATATTATTATACTATATCTTCATAATTA
GCTTTAAAGCAACAGTACTATATCTTAATGCTTTAATTTTGGTTGGTATAGGAATAATTGTAGGTCCTGT
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